За последние годы Институт успешно выполнил ряд крупных проектов:
- в рамках программ Роскосмоса и государственного задания изучено современное экологическое состояние наземных и водных экосистем позиционного района нового российского космодрома «Восточный» (Амурская область) и районов падения отделяемых частей ракет-носителей (Амурская, Магаданская и Сахалинская области, Республика Саха (Якутия), Хабаровский край), в том числе: геологической среды, рельефа, атмосферы, почвенного и растительного покровов, животного мира, поверхностных и грунтовых вод, ландшафтов в целом. Дана комплексная оценка влияния строительства объектов наземной космической инфраструктуры на окружающую среду.
- на основе доработанной компьютерной модели течения на участке р. Обь от с. Фоминское до створа плотины Новосибирской ГЭС с использованием оперативных данных Гидромета на основных гидропостах выполнены прогнозы уровней воды на Верхней Оби в периоды весенних половодий и паводков 2014-2016 гг. В том числе рассчитан с заблаговременностью до нескольких дней (3-5 дней) гидрограф у гидропоста Барнаул.
- участвовал в разработке и выполнении ряда международных, федеральных и региональных природоохранных и водохозяйственных программ («Clean Water», «Вода России – 21-й век», ФЦП «Сибирь» и др.);
- проводил комплексную оценку экологических последствий строительства и эксплуатации крупных технических объектов (ГЭС: Алтайская, Богучанская, Эвенкийская и др., автодороги и газопровода «Алтай»);
- разрабатывал проекты водоохранных зон (водных объектов бассейна р. Обь), мероприятия по снижению степени риска возникающих чрезвычайных ситуаций при эксплуатации гидроузлов (Новосибирская ГЭС);
- проводил экологический мониторинг окружающей среды, медико-экологическую оценку территорий (в том числе подверженной воздействию Семипалатинского ядерного полигона, а также ракетно-космической деятельности космодрома Байконур и строительства космодрома Восточный);
- проводил комплексную оценку современного состояния крупных водных объектов Сибири (озер: Чаны, Кулундинское, Телецкое и др.; рек: Обь, Иртыш и др.);
- осуществлял комплексный эколого-геохимический анализ среды в зонах воздействия горно-рудной промышленности (предприятий Кузбасса и Алтая);
- выполнял территориальное планирование, изучение рекреационных ресурсов и картографирование регионов Сибири.